More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1914 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  74.8 
 
 
124 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  73.17 
 
 
125 aa  186  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 
124 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 
125 aa  184  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 
125 aa  183  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  70.73 
 
 
126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 
125 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
124 aa  172  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  70.09 
 
 
126 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  64.23 
 
 
126 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  65.85 
 
 
125 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 
125 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 
124 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  62.1 
 
 
125 aa  160  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 
124 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 
124 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  65 
 
 
121 aa  159  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 
126 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 
122 aa  159  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 
125 aa  158  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 
121 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 
121 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  63.03 
 
 
121 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  65 
 
 
123 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.1 
 
 
127 aa  155  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 
124 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
124 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 
121 aa  154  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 
124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 
126 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  153  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  153  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  153  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
122 aa  153  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  153  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
122 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
123 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
122 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
123 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
121 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  151  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  60.83 
 
 
121 aa  150  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  62.18 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
123 aa  150  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 
125 aa  149  8.999999999999999e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 
125 aa  149  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  149  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
124 aa  149  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  65 
 
 
121 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  148  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 
123 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  65 
 
 
121 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
125 aa  148  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
125 aa  147  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 
126 aa  147  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  57.85 
 
 
124 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.5 
 
 
124 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
122 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
123 aa  146  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
123 aa  146  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.17 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  57.85 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  63.48 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
123 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  59.84 
 
 
125 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
121 aa  145  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  55.37 
 
 
123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  55.28 
 
 
125 aa  144  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  55.28 
 
 
125 aa  144  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 
125 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
128 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>