256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30486 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  64.08 
 
 
144 aa  204  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  59.44 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  56.55 
 
 
145 aa  188  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  60 
 
 
155 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  45.93 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  42.54 
 
 
159 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  38.06 
 
 
194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  38.06 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  41.73 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  33.81 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  35.82 
 
 
174 aa  97.8  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  37.31 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  32.62 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  37.59 
 
 
171 aa  94.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  35.04 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  35.82 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  35.21 
 
 
153 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  36.57 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  35.82 
 
 
153 aa  93.2  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  35.07 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  34.04 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  34.33 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  33.59 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  29.5 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  33.09 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  33.83 
 
 
178 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  31.45 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  33.06 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  32.64 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 
122 aa  58.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  34.09 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  29.23 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 
123 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 
132 aa  52  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 
123 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  31.06 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  28.03 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  32.58 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 
123 aa  48.1  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  29.23 
 
 
114 aa  48.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0075  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.679156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  27.27 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  25.76 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0073  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.417836  hitchhiker  0.00000000329055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  27.48 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  25.76 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  30.3 
 
 
124 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 
122 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  25.76 
 
 
122 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 
127 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3470  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.879267  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2736  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0371  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.10511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>