268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0502 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 162 aa  323  8.000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  64.38 
 
 		 153 aa  206  9e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  62.67 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  63.01 
 
 		 152 aa  198  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  60.96 
 
 		 153 aa  194  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  46.48 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  45.34 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  44.37 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  49.32 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  44.76 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  43.62 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  52.41 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  42.47 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  45.07 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  44.29 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  46.51 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  46.32 
 
 		 194 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  40.52 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  40.82 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  41.18 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  37.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  37.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  37.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  37.41 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  37.06 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  41.3 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  34.46 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  39.13 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  38.62 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  35.25 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.61 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  33.09 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  32.52 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  34.92 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  34.53 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  32.79 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  32.79 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  32.52 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  32.87 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  34.15 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  32.65 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  32.54 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  30.89 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.16 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  31.69 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  33.1 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57353  predicted protein  30.66 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  31.15 
 
 		 122 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 118 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  31.45 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 121 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 121 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  32.79 
 
 		 122 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  30.89 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 126 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  30.71 
 
 		 118 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  29.79 
 
 		 127 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  28.06 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  51.2  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  33.61 
 
 		 123 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 122 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  28.69 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  26.19 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  26.19 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  30.43 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  29.27 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  31.45 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>