More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1369 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  72.41 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  66.13 
 
 		 124 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  64.71 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 123 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 122 aa  153  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.16 
 
 		 123 aa  153  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  63.72 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.89 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  52 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  54.84 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  53.6 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  55.2 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  55.2 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  55.2 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  60.91 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  54.87 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  56.03 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 126 aa  143  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  55.2 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 121 aa  141  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  59.09 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  55.26 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 124 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  53.45 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  54.47 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  56.14 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>