More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0765 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  64.71 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  64.71 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 124 aa  156  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  57.52 
 
 		 122 aa  140  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  56.2 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.04 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  52.63 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  56.14 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  57.52 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  58.04 
 
 		 125 aa  136  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  56.25 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  54.31 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  54.87 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 116 aa  133  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 118 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 122 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  56.64 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  53.51 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  54.87 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  55.36 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  52.63 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  54.87 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  56.64 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  50 
 
 		 123 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  52.59 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  53.98 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  50.86 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  51.72 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  54.46 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  53.1 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>