277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29591 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  67.13 
 
 		 155 aa  213  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  64.08 
 
 		 146 aa  204  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  62.07 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  66.17 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  38.81 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  36.57 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 194 aa  104  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  38.52 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  36.3 
 
 		 174 aa  98.2  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  38.81 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  37.78 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  35.34 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  38.06 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  34.07 
 
 		 174 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  35.04 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  36.3 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  35.82 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  35.82 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  32.84 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  35.77 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  34.33 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  32.09 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  32.09 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  31.34 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  31.34 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  32.33 
 
 		 178 aa  87.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  35.77 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  35.61 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  32.85 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  33.06 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  31.85 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  30.37 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3470  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.879267  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2736  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0290  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0371  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  26.32 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  25.56 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  25.56 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0789  30S ribosomal protein S13  28.81 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000154932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  25.56 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0075  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.679156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2816  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162634  normal  0.184751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0359  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.16479e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1832  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000154353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0337  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220918  normal  0.0253305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  27.07 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3621  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101768  hitchhiker  0.00000000100437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3737  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0221  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000205657  unclonable  0.0000000000430972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>