More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0497 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  141  4e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  55.36 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  53.39 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2179  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  54.24 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  54.55 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  51.24 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  52.89 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  50 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  49.59 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  51.24 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  50.41 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  53.04 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  50.85 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  47.93 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>