More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1859 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  54.69 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  53.12 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  53.91 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  51.94 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  53.6 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 125 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  51.94 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  49.6 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  50.4 
 
 		 124 aa  123  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  53.49 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  52.85 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  53.97 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  53.6 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  53.6 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  48.39 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  54.26 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  49.6 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  52.68 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  52.68 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  53.6 
 
 		 123 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  48.82 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  52 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  53.12 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  52 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  49.19 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  48.8 
 
 		 124 aa  119  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  50.4 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  51.2 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  50.4 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  55.36 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3294  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  49.59 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  52.34 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  49.6 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  49.19 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3157  30S ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  50.4 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  52.76 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  51.79 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  51.79 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  49.19 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5048  ribosomal protein S13  54.03 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  51.61 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  47.2 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  54.46 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3470  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.879267  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  50.39 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2736  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  50.39 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0371  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  51.22 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0290  30S ribosomal protein S13  53.57 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  54.46 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>