More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0204 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  55.28 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  55.74 
 
 		 123 aa  140  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  54.1 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  57.98 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  56.52 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  54.47 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  54.92 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  55.12 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 124 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 125 aa  131  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  53.12 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  52.8 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  51.69 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 123 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  53.39 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  51.2 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  54.1 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  52.94 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  55.08 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  53.28 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  53.23 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  52.42 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  53.12 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  51.61 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  52 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  49.19 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  54.24 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  50.85 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  50.81 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  55.08 
 
 		 122 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  55.08 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  50 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  54.31 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  50.82 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  48.39 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  48.39 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  51.2 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  51.64 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  48.39 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  51.97 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  51.61 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  53.45 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  52.17 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  52.46 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  52.54 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>