More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2902 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  66 
 
 		 151 aa  205  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  65.31 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  62 
 
 		 153 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  55.78 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  52.08 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  52.03 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  50.69 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  47.95 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  50.36 
 
 		 171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  46.53 
 
 		 174 aa  143  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  48.2 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  43.75 
 
 		 176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  42.86 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  40.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  41.78 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  40.41 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  44.29 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  41.38 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  41.38 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  40 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  37.93 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  39.04 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  42.86 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  38.52 
 
 		 194 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  37.14 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  37.31 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.06 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  38.51 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  36.15 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  36.81 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  33.57 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4297  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000201851  unclonable  0.0000000000355605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  35.38 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4668  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  35.42 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1011  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000227796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03149  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0567144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3684  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000603669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3492  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3593  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00190616  normal  0.0522368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3781  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000117376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0415  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000337677  unclonable  0.000000013853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4620  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000695624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03100  hypothetical protein  28.46 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0375392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0235  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000771174  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3737  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0221  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224904  unclonable  0.0000000000165465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0216  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000313091  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0221  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000205657  unclonable  0.0000000000430972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>