More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1396 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  100 
 
 		 148 aa  299  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  48.97 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  45.89 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  45.89 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  45.89 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  44.52 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  45.64 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  44.83 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  41.78 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  44.83 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  44.14 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  43.45 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  40.41 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  45.07 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  46.9 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  42.47 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  42.54 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  41.84 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  40.43 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  37.04 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  37.31 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.57 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  38.06 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  41.73 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  35.17 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  34.25 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  35.38 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  34.81 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  33.83 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  34.81 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  33.83 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  34.81 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0316  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0714162  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  35.38 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  33.83 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  33.83 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  34.59 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  35.37 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  33.1 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  34.59 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  32.33 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2194  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  32.41 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  35.86 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  32.88 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  33.56 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  35.11 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  33.79 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>