More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5150 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
126 aa  249  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  76.19 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  73.02 
 
 
126 aa  195  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  74.6 
 
 
126 aa  193  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23550  SSU ribosomal protein S13P  74.59 
 
 
124 aa  190  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  74.6 
 
 
126 aa  189  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  83.33 
 
 
126 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  73.02 
 
 
126 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  73.02 
 
 
126 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  73.17 
 
 
123 aa  187  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 
124 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  72.36 
 
 
124 aa  185  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  70.4 
 
 
125 aa  184  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  81.75 
 
 
126 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1115  30S ribosomal protein S13  80.95 
 
 
126 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0331  30S ribosomal protein S13  77.78 
 
 
126 aa  183  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13028  decreased coverage  0.000403081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  69.84 
 
 
126 aa  183  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 
124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  72.58 
 
 
125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  68.25 
 
 
126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 
123 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
125 aa  181  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  72.95 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  69.92 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  69.92 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  69.92 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  68 
 
 
125 aa  180  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  69.92 
 
 
124 aa  179  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  69.11 
 
 
124 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  69.92 
 
 
124 aa  178  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
124 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  69.11 
 
 
124 aa  176  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  69.92 
 
 
125 aa  176  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  68.38 
 
 
126 aa  174  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  69.23 
 
 
126 aa  173  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  69.23 
 
 
126 aa  170  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  66.39 
 
 
122 aa  170  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 
122 aa  169  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
124 aa  168  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  69.05 
 
 
126 aa  167  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 
126 aa  167  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  67.52 
 
 
126 aa  166  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  68 
 
 
125 aa  166  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 
126 aa  165  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 
122 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  64.75 
 
 
122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  68.38 
 
 
126 aa  163  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 
123 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  64.75 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  62.3 
 
 
122 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 
123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 
123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
122 aa  159  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  65.57 
 
 
123 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  67.52 
 
 
122 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
122 aa  157  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
122 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
123 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 
122 aa  155  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 
122 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
124 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  61.16 
 
 
123 aa  154  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.98 
 
 
121 aa  153  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  62.81 
 
 
124 aa  153  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 
121 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 
124 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 
122 aa  152  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
123 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 
122 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 
123 aa  150  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  60.66 
 
 
123 aa  151  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
121 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
122 aa  150  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.84 
 
 
122 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
122 aa  150  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
121 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
121 aa  150  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 
122 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
121 aa  150  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
127 aa  149  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 
122 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
132 aa  148  2e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>