More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1614 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  67.37 
 
 		 204 aa  274  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  64.67 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  64.71 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  62.89 
 
 		 194 aa  248  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  57.92 
 
 		 185 aa  222  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  55.19 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  51.56 
 
 		 204 aa  201  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  51.91 
 
 		 185 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  53.51 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  50.27 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  51.34 
 
 		 188 aa  191  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 202 aa  190  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  50.8 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  46.52 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  48.09 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  46.49 
 
 		 224 aa  168  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  43.3 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  44.39 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  44.32 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  43.32 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  44.57 
 
 		 224 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  43.46 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  42.93 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  41.18 
 
 		 234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  40.22 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  41.15 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  36.79 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.82 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2911  ribosomal protein S7  35.04 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000104481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  35.21 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  28.46 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  32.65 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  32.84 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  32.31 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  27.69 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  29.93 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4919  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  29.73 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  31.11 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  35.56 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  30.15 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  29.25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  35 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  29.63 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>