More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1197 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  78.65 
 
 
194 aa  322  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  69.95 
 
 
224 aa  265  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  67.74 
 
 
200 aa  264  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  67.76 
 
 
224 aa  263  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  67.76 
 
 
223 aa  263  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  67.03 
 
 
223 aa  260  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  60.54 
 
 
234 aa  250  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  54.26 
 
 
188 aa  207  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  56.22 
 
 
185 aa  207  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  57.22 
 
 
187 aa  206  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  52.97 
 
 
185 aa  204  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  52.66 
 
 
188 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  54.12 
 
 
199 aa  204  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  52.66 
 
 
188 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  50.53 
 
 
188 aa  201  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  51.63 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  51.06 
 
 
188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  49.46 
 
 
204 aa  194  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  54.3 
 
 
215 aa  191  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  50.54 
 
 
205 aa  190  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  52.38 
 
 
225 aa  190  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  51.32 
 
 
194 aa  187  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  46.2 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  51.87 
 
 
228 aa  180  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  46.2 
 
 
202 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  47.54 
 
 
197 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  46.35 
 
 
217 aa  175  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 
204 aa  171  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  46.45 
 
 
204 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  43.3 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  48.09 
 
 
194 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  43.07 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  43.07 
 
 
155 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
157 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  36.62 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  39.42 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  37.23 
 
 
155 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  38.97 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 
155 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3276  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000398939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
156 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  35.17 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  38.3 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  35.77 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  36.23 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  35.04 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  34.48 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  38.69 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>