More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2596 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  316  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  87.66 
 
 		 156 aa  280  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  86.36 
 
 		 156 aa  276  7e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  72.08 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  71.43 
 
 		 156 aa  240  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  72.73 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  74.03 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  73.38 
 
 		 156 aa  236  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  72.08 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  72.08 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 		 156 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  70.78 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  69.48 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  67.53 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  69.48 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  69.48 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 		 156 aa  222  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 		 155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  214  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  59.74 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  61.69 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  59.09 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  61.04 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  197  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 155 aa  197  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 155 aa  197  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>