More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0613 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  320  4e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  68.18 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  68.18 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  68.18 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  67.1 
 
 
155 aa  225  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 
155 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  67.57 
 
 
156 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  221  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  221  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  221  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  65.54 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 
155 aa  218  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  216  7e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  216  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  215  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  214  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  214  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  213  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  64.19 
 
 
156 aa  213  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  64.19 
 
 
156 aa  213  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  210  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 
157 aa  206  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 
156 aa  203  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  203  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  202  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  201  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  199  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  196  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  194  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  193  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  193  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  193  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 
155 aa  193  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.06 
 
 
157 aa  190  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  190  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
155 aa  189  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 
157 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  56.49 
 
 
156 aa  189  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  188  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  188  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 
156 aa  188  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  188  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  187  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  187  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  187  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  54.84 
 
 
155 aa  187  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  56.46 
 
 
156 aa  186  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  187  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  186  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  186  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 
155 aa  186  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
155 aa  186  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  186  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  50.97 
 
 
155 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>