More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3805 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  89.74 
 
 		 156 aa  296  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  90.38 
 
 		 156 aa  293  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  90.38 
 
 		 156 aa  293  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  90.38 
 
 		 156 aa  293  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  89.74 
 
 		 156 aa  293  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  88.46 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  89.1 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  87.18 
 
 		 156 aa  288  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  85.9 
 
 		 156 aa  280  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  84.62 
 
 		 156 aa  277  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 		 156 aa  276  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  273  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  273  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  83.33 
 
 		 156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 		 156 aa  271  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 		 156 aa  270  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  270  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 		 156 aa  268  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  267  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  266  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  266  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  78.85 
 
 		 156 aa  266  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  80.77 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  261  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  254  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 		 156 aa  250  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  63.46 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  62.82 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 157 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 155 aa  201  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>