More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf313 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  321  3e-87  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  70.78 
 
 
155 aa  236  6.999999999999999e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  68.18 
 
 
155 aa  230  6e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  228  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  224  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  223  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  221  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  221  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  221  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  221  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  220  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  219  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  219  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  213  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
155 aa  212  9.999999999999999e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  210  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  208  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
155 aa  207  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  204  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  204  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  203  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  203  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  203  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 
157 aa  201  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  201  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  57.69 
 
 
156 aa  201  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  57.69 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  198  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  198  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  197  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  198  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  57.05 
 
 
156 aa  197  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  197  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  197  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  197  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  56.13 
 
 
156 aa  196  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  60 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  194  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  194  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  194  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 
157 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>