More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0288 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  262  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 		 156 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  256  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  239  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  237  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  233  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 		 155 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 157 aa  227  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 		 155 aa  222  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 		 155 aa  223  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  58.97 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  57.05 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  55.77 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  57.69 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  55.77 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1222  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 		 157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000188964  hitchhiker  0.00370144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>