More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0356 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  278  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  274  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  270  6e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 155 aa  236  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  66.22 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  64.52 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  64.52 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 155 aa  207  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 157 aa  204  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  60.76 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  56.13 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  197  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  58.11 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>