More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0236 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  254  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  254  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  254  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  236  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  233  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  229  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  227  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  223  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  223  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  60.26 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  58.97 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  58.97 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  58.64 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  59.62 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  62.84 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 155 aa  200  8e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>