More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2262 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  271  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  226  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1222  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000188964  hitchhiker  0.00370144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  58.49 
 
 		 159 aa  207  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0390  30S ribosomal protein S7  55.75 
 
 		 175 aa  203  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0365  30S ribosomal protein S7  55.75 
 
 		 175 aa  203  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  60.9 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  57.69 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>