More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0622 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  91.67 
 
 		 156 aa  293  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  87.82 
 
 		 156 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  85.9 
 
 		 156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  85.9 
 
 		 156 aa  280  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  269  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  233  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  229  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  214  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  59.62 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  59.26 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 179 aa  201  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  58.23 
 
 		 158 aa  200  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>