More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2861 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  317  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  91.67 
 
 		 156 aa  293  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  87.18 
 
 		 156 aa  286  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  87.18 
 
 		 156 aa  286  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  87.18 
 
 		 156 aa  285  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  259  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  256  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  236  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  61.11 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  206  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  58.86 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  59.62 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>