More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2778 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  226  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 		 157 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  61.39 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 		 155 aa  204  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 157 aa  203  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>