More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0584 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  91.67 
 
 		 156 aa  300  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 		 156 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 		 156 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 		 156 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 		 156 aa  276  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 		 156 aa  275  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 		 156 aa  274  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  267  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  77.56 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  77.56 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 156 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  248  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  71.97 
 
 		 157 aa  239  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  72.78 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  69.62 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  74.48 
 
 		 156 aa  234  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  60.51 
 
 		 157 aa  203  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 155 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 155 aa  200  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  58.97 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>