More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0291 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  67.09 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  217  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0390  30S ribosomal protein S7  62.64 
 
 		 175 aa  214  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0365  30S ribosomal protein S7  62.64 
 
 		 175 aa  214  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  68.35 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  64.38 
 
 		 158 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  65.61 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 179 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  64.38 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  62.5 
 
 		 158 aa  207  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 		 157 aa  205  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  62.03 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>