More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0315 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  313  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  267  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 		 156 aa  264  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  263  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  262  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  263  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  260  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  78.34 
 
 		 157 aa  254  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  253  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  78.34 
 
 		 157 aa  253  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0334  30S ribosomal protein S7  77.71 
 
 		 157 aa  252  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  77.07 
 
 		 157 aa  250  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000299452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  77.07 
 
 		 157 aa  250  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  0.00000162454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  76.43 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4919  30S ribosomal protein S7  75.8 
 
 		 157 aa  248  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3799  30S ribosomal protein S7  75.16 
 
 		 157 aa  246  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000156972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0199  30S ribosomal protein S7  75.8 
 
 		 157 aa  245  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000133398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  227  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  222  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 155 aa  220  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  220  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  219  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  67.95 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 157 aa  213  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  213  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118466  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>