More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0252 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
157 aa  315  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0199  30S ribosomal protein S7  98.73 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000133398  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4919  30S ribosomal protein S7  89.81 
 
 
157 aa  292  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3799  30S ribosomal protein S7  89.17 
 
 
157 aa  290  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000156972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  87.9 
 
 
157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0334  30S ribosomal protein S7  87.26 
 
 
157 aa  283  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  87.26 
 
 
157 aa  283  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  85.99 
 
 
157 aa  278  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000299452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  85.99 
 
 
157 aa  278  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  0.00000162454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  85.35 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  84.71 
 
 
156 aa  271  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 
156 aa  263  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 
156 aa  263  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  83.44 
 
 
156 aa  263  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  81.53 
 
 
156 aa  260  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  81.53 
 
 
156 aa  260  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  81.53 
 
 
156 aa  260  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  82.17 
 
 
156 aa  260  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  82.17 
 
 
156 aa  259  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  80.89 
 
 
156 aa  258  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  81.53 
 
 
156 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  80.25 
 
 
156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  77.71 
 
 
156 aa  256  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  79.62 
 
 
156 aa  256  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  76.43 
 
 
156 aa  248  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  75.8 
 
 
156 aa  246  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  75.8 
 
 
156 aa  245  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  74.52 
 
 
156 aa  240  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  69.43 
 
 
156 aa  224  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  69.43 
 
 
157 aa  223  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  222  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  70.06 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118466  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 
156 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 
156 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  70.25 
 
 
156 aa  217  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 
156 aa  217  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
155 aa  216  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  67.52 
 
 
156 aa  216  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  69.62 
 
 
156 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  215  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  64.97 
 
 
179 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
156 aa  213  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  210  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
156 aa  210  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
156 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
157 aa  209  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  64.33 
 
 
156 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  62.42 
 
 
156 aa  209  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
156 aa  209  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
156 aa  208  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  63.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>