More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4766 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  318  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  88.46 
 
 
156 aa  290  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  87.82 
 
 
156 aa  285  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  87.82 
 
 
156 aa  285  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  86.54 
 
 
156 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  279  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  277  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  276  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  275  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  274  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  274  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  273  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  273  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  273  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  82.69 
 
 
179 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  272  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  268  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  268  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  268  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  267  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  75.64 
 
 
156 aa  249  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 
156 aa  244  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 
156 aa  244  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
155 aa  229  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
155 aa  228  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  228  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  228  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  70.7 
 
 
157 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  71.34 
 
 
157 aa  227  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  228  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  227  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  69.43 
 
 
157 aa  227  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  225  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  224  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  224  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  224  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  224  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  223  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 
157 aa  223  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  223  7e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
157 aa  223  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000299452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
157 aa  223  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  0.00000162454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  69.87 
 
 
155 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 
157 aa  221  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118466  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  222  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  221  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  220  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  220  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0390  30S ribosomal protein S7  63.79 
 
 
175 aa  218  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0365  30S ribosomal protein S7  63.79 
 
 
175 aa  218  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  218  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 
157 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0334  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 
157 aa  217  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  217  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
155 aa  216  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  216  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  216  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  214  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>