More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2715 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  277  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  82.05 
 
 
156 aa  274  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 
156 aa  267  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 
156 aa  263  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 
156 aa  263  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 
156 aa  263  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 
156 aa  263  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 
156 aa  260  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  77.56 
 
 
156 aa  259  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 
156 aa  253  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  76.43 
 
 
157 aa  253  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  251  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  75 
 
 
156 aa  249  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 
156 aa  248  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 
156 aa  247  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 
156 aa  244  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 
156 aa  244  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  244  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 
156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 
156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  236  8e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  234  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  234  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  234  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  233  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  228  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  228  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  227  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  69.48 
 
 
155 aa  227  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
155 aa  225  2e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
155 aa  224  3e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  68.18 
 
 
155 aa  221  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  221  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  66.88 
 
 
157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  213  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  210  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
155 aa  210  7e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  208  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  206  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  206  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  59.62 
 
 
156 aa  205  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  204  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  204  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  60.9 
 
 
156 aa  204  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  203  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  203  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  203  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  203  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  203  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  203  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  202  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  202  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  202  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  202  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  201  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  201  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>