More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2963 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  84.18 
 
 		 158 aa  285  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  75.95 
 
 		 156 aa  246  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  246  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  244  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  243  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  74.68 
 
 		 156 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  75.32 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  74.05 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  70.89 
 
 		 157 aa  241  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  73.42 
 
 		 156 aa  240  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  72.78 
 
 		 156 aa  240  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  74.05 
 
 		 156 aa  240  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  72.78 
 
 		 156 aa  239  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  73.42 
 
 		 156 aa  237  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  68.99 
 
 		 156 aa  237  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  72.15 
 
 		 156 aa  236  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  72.78 
 
 		 156 aa  236  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  71.52 
 
 		 156 aa  236  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  73.42 
 
 		 156 aa  236  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  70.89 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  69.62 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  69.62 
 
 		 156 aa  234  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  70.25 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  74.05 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  72.15 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  70.89 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  71.52 
 
 		 156 aa  231  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  70.25 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  68.99 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  69.62 
 
 		 156 aa  228  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  72.11 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  66.46 
 
 		 156 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 155 aa  209  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 155 aa  207  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 155 aa  207  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  61.39 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 155 aa  208  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 179 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  62.66 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  62.5 
 
 		 157 aa  207  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  63.92 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  60.76 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  62.03 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  60.76 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  62.03 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>