More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0211 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 		 156 aa  257  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  250  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  249  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  240  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  239  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  239  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  237  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  233  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  66.24 
 
 		 157 aa  227  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 155 aa  226  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 		 155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  64.19 
 
 		 155 aa  213  8e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  209  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  61.15 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  57.69 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>