More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0188 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  3e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  61.94 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  60 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  55.7 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  56.33 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 155 aa  191  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 155 aa  191  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 155 aa  190  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  53.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 155 aa  185  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>