More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0843 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  227  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  224  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  223  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  223  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  223  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  219  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  218  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  216  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  216  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  214  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  214  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  214  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  214  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  214  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  213  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  213  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  213  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  62.58 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  209  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  209  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  209  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  208  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
155 aa  208  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  208  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  208  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  208  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  61.39 
 
 
158 aa  208  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  208  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
155 aa  207  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  207  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>