More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2718 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  267  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  254  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  254  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  75 
 
 		 156 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  251  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  247  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  244  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  244  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  241  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  73.08 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  237  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  234  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  69.48 
 
 		 155 aa  226  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  221  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 		 155 aa  214  4e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  206  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  204  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.24 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 		 157 aa  200  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  200  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  56.41 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2020  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>