More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0458 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  320  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  238  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  73.08 
 
 
156 aa  238  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  235  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  235  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 
156 aa  234  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  233  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  229  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  228  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  227  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  227  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  222  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  219  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  219  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  219  8e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  219  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 
155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  216  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  214  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  213  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  61.54 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  209  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
157 aa  206  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  205  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
155 aa  202  1e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  202  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  201  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  200  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  200  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  200  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
155 aa  199  9.999999999999999e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  58.33 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  197  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  197  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
155 aa  196  7e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  196  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  194  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  59.62 
 
 
156 aa  193  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  193  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  193  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  192  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  192  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  192  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  192  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>