More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12674 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  76.29 
 
 
215 aa  313  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  75.66 
 
 
225 aa  312  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  76.32 
 
 
228 aa  308  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  74.23 
 
 
205 aa  301  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  53.68 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  51.58 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  52.15 
 
 
223 aa  194  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
224 aa  190  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  49.47 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  51.32 
 
 
193 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
188 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  48.95 
 
 
188 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  48.95 
 
 
188 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  49.74 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  45.7 
 
 
234 aa  175  4e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  45.21 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  44.68 
 
 
185 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  44.39 
 
 
186 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  45.26 
 
 
188 aa  168  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  44.74 
 
 
188 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  44.39 
 
 
202 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  43.01 
 
 
197 aa  165  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  43.32 
 
 
202 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  42.25 
 
 
204 aa  159  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  40.64 
 
 
202 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  46.24 
 
 
187 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  40.21 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  41.58 
 
 
199 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  40.86 
 
 
204 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  39.78 
 
 
204 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  37.82 
 
 
194 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  40.86 
 
 
194 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  33.09 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  32.26 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
157 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  30.94 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  30.22 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  31.45 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
155 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  30.15 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  31.94 
 
 
156 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  28.78 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 
156 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  28.47 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  32.12 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  32.37 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  29.2 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  30.23 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  32.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>