More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0784 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  76.06 
 
 
188 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  75.53 
 
 
188 aa  303  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  75.53 
 
 
188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  70.74 
 
 
188 aa  290  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  54.05 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 
185 aa  216  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  56.38 
 
 
187 aa  216  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  53.26 
 
 
197 aa  214  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  54.01 
 
 
200 aa  208  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  54.35 
 
 
204 aa  205  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 
185 aa  203  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  50.53 
 
 
194 aa  202  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  50.53 
 
 
193 aa  201  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
204 aa  197  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  48.11 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 
194 aa  195  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  52.15 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 
223 aa  194  9e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 
202 aa  190  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
194 aa  189  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 
204 aa  189  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  48.65 
 
 
202 aa  188  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  47.85 
 
 
223 aa  186  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  48.11 
 
 
202 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 
224 aa  185  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  46.77 
 
 
234 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  49.2 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.74 
 
 
194 aa  167  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  43.85 
 
 
215 aa  166  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  45.74 
 
 
228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  41.58 
 
 
225 aa  155  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  44.27 
 
 
199 aa  153  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  33.81 
 
 
155 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  35.97 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  30.43 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  32.23 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  31.16 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 
155 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 
156 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  31.58 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  32.35 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  31.82 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  33.57 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  31.58 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  30.56 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.1 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  31.62 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  31.85 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
155 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>