More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0210 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  96.81 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  96.81 
 
 		 188 aa  376  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  83.51 
 
 		 188 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  76.06 
 
 		 188 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  52.15 
 
 		 185 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  55.85 
 
 		 187 aa  207  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  54.26 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  56.15 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  50.81 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  54.84 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  51.63 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  51.6 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  53.23 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  51.08 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  51.09 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  51.09 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  52.94 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  48.65 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  50.27 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  48.11 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  47.85 
 
 		 234 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  47.28 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  47.57 
 
 		 202 aa  180  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  50 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  49.46 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  50.53 
 
 		 228 aa  178  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  47.57 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  47.06 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  46.84 
 
 		 225 aa  170  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  45.83 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  36.96 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  32.12 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  32.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  27.94 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  34.59 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  30.15 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  31.21 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  34.71 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  31.97 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  30.99 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  30.99 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  28.99 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  35.11 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  30.15 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  31.21 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  30.07 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  30.15 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  31.21 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  30.6 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  29.41 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0261  30S ribosomal protein S7  34.27 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  32.84 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  32.35 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  30.88 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  32.86 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  33.61 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>