297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK03230 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  73.5 
 
 		 215 aa  314  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  74.23 
 
 		 194 aa  301  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  72.36 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  67.55 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  53.76 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  50.5 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  49.01 
 
 		 224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  49.5 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  48.02 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  50.54 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  52.41 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  52.94 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  52.41 
 
 		 188 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  49.2 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  47.31 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  46.49 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  45.16 
 
 		 185 aa  175  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  40.1 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  48.91 
 
 		 187 aa  171  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  45.65 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  45.11 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  42.7 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  44.32 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  43.78 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  44.02 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  42.19 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  42.19 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  35.25 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  32.9 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  38.13 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  31.43 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  37.41 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  34.53 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  32.61 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1855  30S ribosomal protein S7  35.42 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0321783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  32.62 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  30.22 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  30 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  33.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2300  30S ribosomal protein S7  33.57 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000109859  decreased coverage  0.000727759 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  30.94 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  32.37 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>