More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1872 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1872  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  318  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.339504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2911  ribosomal protein S7  74.36 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000104481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 155 aa  184  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 155 aa  184  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  48.72 
 
 		 156 aa  173  9e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  50.94 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  50.32 
 
 		 156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  50.97 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  53.06 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  50 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  52.38 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  49.36 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  52.41 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  50.64 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>