More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0394 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  316  7e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  222  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  222  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 
156 aa  221  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  218  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  215  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  67.95 
 
 
156 aa  215  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  215  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  67.31 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  214  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  214  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  213  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  213  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  63.46 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  210  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  208  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  206  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  62.82 
 
 
156 aa  203  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  202  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  200  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  193  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  56.05 
 
 
157 aa  187  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  187  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  185  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  185  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
157 aa  185  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  184  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  56.41 
 
 
156 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  184  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  183  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  54.32 
 
 
162 aa  180  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  179  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  54.09 
 
 
159 aa  179  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  55.77 
 
 
155 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  179  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  179  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
157 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  54 
 
 
155 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  54 
 
 
155 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  55.77 
 
 
156 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  178  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>