More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1832 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  320  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
155 aa  210  7.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  207  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  206  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0399  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  206  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000050235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  204  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  204  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3829  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000524662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
179 aa  202  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0317  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3537  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2775e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3622  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000085728  hitchhiker  0.000566126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3715  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  201  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  201  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  200  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  200  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  60.26 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  197  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  56.96 
 
 
158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  193  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  193  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
155 aa  192  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 
156 aa  192  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  56.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  53.9 
 
 
155 aa  190  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  190  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  190  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  190  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  59.24 
 
 
157 aa  190  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  190  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 
155 aa  189  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  51.3 
 
 
155 aa  189  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  189  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  189  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 
158 aa  189  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  53.55 
 
 
156 aa  189  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  189  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  188  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
157 aa  187  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  57.32 
 
 
157 aa  187  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  187  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>