More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0509 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  77.94 
 
 
202 aa  324  6e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  75.98 
 
 
202 aa  321  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  80.33 
 
 
202 aa  313  8e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  72.91 
 
 
217 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  54.95 
 
 
204 aa  227  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  57.38 
 
 
197 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  54.35 
 
 
185 aa  221  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  54.89 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  54.89 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  57.38 
 
 
204 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  51.56 
 
 
194 aa  201  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  52.33 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  50.82 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  49.46 
 
 
193 aa  194  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
194 aa  190  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 
188 aa  189  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  46.03 
 
 
234 aa  186  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  48.37 
 
 
200 aa  186  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  46.24 
 
 
223 aa  184  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  47.31 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  45.7 
 
 
223 aa  182  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 
188 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 
188 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  45.16 
 
 
224 aa  180  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 
188 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  47.57 
 
 
188 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  42.7 
 
 
205 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  42.25 
 
 
194 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  38.6 
 
 
215 aa  155  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  40.31 
 
 
225 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  42.93 
 
 
199 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  41.62 
 
 
228 aa  147  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  35.29 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  34.31 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  34.78 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  32.85 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  32.82 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  33.58 
 
 
156 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  35.07 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  35.04 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  35.56 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  33.81 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  34.31 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  32.12 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0229  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
157 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  31.16 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  32.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
159 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  33.33 
 
 
155 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  30 
 
 
157 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 
155 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  31.11 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  31.06 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  34.81 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  32.76 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  30.37 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
155 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  31.85 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  32.85 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  29.93 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  30.08 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  32.59 
 
 
156 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>