More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0678 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  84.57 
 
 
188 aa  340  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  84.57 
 
 
188 aa  340  7e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  83.51 
 
 
188 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  70.74 
 
 
188 aa  290  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 
185 aa  221  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  51.35 
 
 
186 aa  208  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
185 aa  201  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  53.48 
 
 
200 aa  201  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  48.91 
 
 
197 aa  200  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  51.6 
 
 
187 aa  197  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
194 aa  197  7e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  51.06 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
224 aa  193  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
223 aa  192  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  49.46 
 
 
223 aa  191  6e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  50 
 
 
204 aa  189  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 
224 aa  189  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 
217 aa  184  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  46.52 
 
 
194 aa  184  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  45.65 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  46.49 
 
 
202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  49.73 
 
 
205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  47.57 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  48.37 
 
 
194 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  44.09 
 
 
234 aa  177  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  45.41 
 
 
204 aa  177  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  43.78 
 
 
202 aa  175  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.26 
 
 
194 aa  168  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  46.28 
 
 
228 aa  165  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  44.39 
 
 
215 aa  164  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  44.21 
 
 
225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  43.75 
 
 
199 aa  155  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  34.62 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  34.06 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  32.61 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  34.06 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  33.08 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  32.09 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  32.82 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  32.17 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  32.82 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  32.82 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  32.82 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  35.34 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  29.85 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  33.09 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  31.88 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  30.3 
 
 
156 aa  58.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  31.65 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  34.33 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  32.14 
 
 
158 aa  57.8  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1336  ribosomal protein S7  31.43 
 
 
156 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  30.66 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  36.36 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  31.3 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  33.88 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  31.34 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  30.83 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  31.39 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  31.01 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  29.71 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  30.43 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  27.21 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  30.53 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  30.3 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  31.01 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  31.62 
 
 
155 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  35.82 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2822  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0935176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  28.57 
 
 
158 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  32.35 
 
 
155 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  33.33 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  34.85 
 
 
155 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  30 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  32.06 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>