More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2233 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  88.39 
 
 
155 aa  280  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0285  30S ribosomal protein S7  89.03 
 
 
155 aa  280  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000325216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  88.39 
 
 
155 aa  275  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1855  30S ribosomal protein S7  83.87 
 
 
155 aa  268  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0321783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2300  30S ribosomal protein S7  79.35 
 
 
155 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000109859  decreased coverage  0.000727759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  76.13 
 
 
155 aa  242  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
157 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 
156 aa  183  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  60.14 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  57.96 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
155 aa  180  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
156 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 
156 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 
156 aa  179  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  56.05 
 
 
155 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  59.44 
 
 
156 aa  176  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  54.9 
 
 
156 aa  176  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  56.21 
 
 
155 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  54.14 
 
 
156 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  175  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  55.7 
 
 
157 aa  174  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  173  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  53.38 
 
 
157 aa  173  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 
156 aa  173  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  56.76 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
156 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  56.03 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  50.98 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 
156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  51.97 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  54.73 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  51.32 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  51.32 
 
 
156 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  52.23 
 
 
156 aa  170  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  51.97 
 
 
156 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  53.29 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  49.68 
 
 
156 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  50 
 
 
155 aa  169  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  52.7 
 
 
156 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  50.99 
 
 
156 aa  169  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  51.35 
 
 
156 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  52.03 
 
 
155 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  51.35 
 
 
156 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  49.34 
 
 
156 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  52.7 
 
 
156 aa  168  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  50.96 
 
 
156 aa  169  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  52.7 
 
 
156 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  51.35 
 
 
156 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 
156 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>