More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1048 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0388  30S ribosomal protein S7  59.87 
 
 		 157 aa  197  6e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 157 aa  186  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  53.85 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  55.78 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  53.38 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  50 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>