More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0886 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2020  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16331  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0322  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.332959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  80.13 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  76.28 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23621  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  253  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.275581 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  79.49 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  78.85 
 
 		 156 aa  250  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1076  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19511  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  75.64 
 
 		 155 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  73.72 
 
 		 156 aa  240  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 156 aa  234  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 		 156 aa  210  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  59.62 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 		 156 aa  196  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  56.05 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  53.5 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.33 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 		 155 aa  186  9e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  183  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  51.95 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  51.92 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  50 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 		 156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>