More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2068 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2068  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000773315  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2300  30S ribosomal protein S7  80 
 
 
155 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000109859  decreased coverage  0.000727759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0176  30S ribosomal protein S7  76.13 
 
 
155 aa  243  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.461741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2233  30S ribosomal protein S7  76.13 
 
 
155 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2427  30S ribosomal protein S7  74.84 
 
 
155 aa  239  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0740157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1855  30S ribosomal protein S7  71.61 
 
 
155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0321783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0285  30S ribosomal protein S7  74.19 
 
 
155 aa  231  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000325216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
157 aa  177  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  58.74 
 
 
156 aa  176  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  55.41 
 
 
155 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  56.85 
 
 
156 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  58.04 
 
 
156 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
157 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  56.69 
 
 
155 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 
155 aa  174  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 
156 aa  175  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  58.04 
 
 
156 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.85 
 
 
156 aa  174  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  52.94 
 
 
156 aa  174  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  58.22 
 
 
156 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  58.22 
 
 
156 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  55.86 
 
 
158 aa  174  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  56.85 
 
 
156 aa  173  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  173  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  57.53 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0269  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000299452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0274  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165501  hitchhiker  0.00000162454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1260  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  57.34 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  55.94 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  53.42 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  58.04 
 
 
156 aa  169  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
156 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0387  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
157 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00747673  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
155 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4919  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
157 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
156 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
157 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
156 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  56.16 
 
 
156 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  53.1 
 
 
158 aa  168  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0334  30S ribosomal protein S7  52.05 
 
 
157 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  51.37 
 
 
156 aa  168  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  167  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  167  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2186  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
157 aa  167  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  decreased coverage  0.00846065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
156 aa  167  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  53.1 
 
 
158 aa  167  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  55.24 
 
 
156 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  167  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  56.16 
 
 
156 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  166  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1896  30S ribosomal protein S7  53.42 
 
 
157 aa  166  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118466  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0199  30S ribosomal protein S7  52.05 
 
 
157 aa  166  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000133398  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  56.85 
 
 
156 aa  166  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  166  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 
156 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1862  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
157 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032235  normal  0.176384 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0388  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
157 aa  165  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 
156 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  52.87 
 
 
156 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  165  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  52.74 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  56.64 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  51.59 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>